好的處理方式，可以將咖啡豐富的風味引導出來。就像葡萄酒是需要經過好的釀造才能產出風味絕佳的酒，
處理法對生豆而言也類似，不同的處理法會產生不同的特色風味。
日曬法(Dry process/Natural method)
日曬法(Dry process/Natural method)是咖啡豆最古老、最原始的處理法。一千多年前，阿拉伯人就以此法處理咖啡。是將採收的咖啡櫻桃放置在露臺上直接曝曬，直接接收陽光曝曬(大約需要27天-30天)，把水分從60%曬到只剩下12%左右完成。這個處理法，概念很簡單、不太花錢，但是有很多的變量與風險；有很長一段時間是用在處理品質不是這麼好的豆子上。
風味呈現：酸度柔和與均勻的苦味，稠度較濃、層次豐富、甜度較爲明顯。，品質好的日曬豆會帶有水果味或酒香。
日曬乾燥：將新鮮的咖啡果實放到曝曬場進行日曬乾燥，經過約2——4周的不停翻動自然乾燥至含水量剩12%左右。使咖啡櫻桃均勻受熱，乾燥後咖啡果核與外皮會分開，再以脫殼機脫去果肉、果皮..等，進行篩選就完成了。
也門摩卡、埃塞俄比亞哈拉、巴西、印尼蘇拉維西的咖啡豆多用此法處理。
水洗法(Wet process/Washed method)
水洗法是由荷蘭人於18世紀發明的技術，適合多雨的地區，雖然過程相當繁瑣，但卻是目前較爲普遍的生豆處理法，佔約70%的咖啡總量。將採收的漿果以去果皮機將大部分的果肉從咖啡豆上分離，再將帶殼豆導引至一個乾淨的水槽裏，浸泡在水中進行發酵以徹底去除殘餘的果肉層。透過水處理，未熟豆及瑕疵豆會因爲浮力的關係而被挑選出來，發酵的過程也比較好控制，因此風味上不像日曬豆有雜味，而是呈現明顯果酸、複雜度稍強以及更乾淨(沒有任何負面風味的存在，像是澀感或尖銳感)的杯中特質。但也是因爲太過“乾淨”，風味的豐富度也稍弱。
風味呈現：酸度較爲強烈，口感上則較乾淨、清爽而明亮。
篩除浮豆：將咖啡果實以清水沖洗後將浮在水面上的未成熟果實撈除。
脫除果肉：將新鮮果實送入果肉篩除機進行果皮果肉的脫除。
去除果膠：去除果肉後的種子移入發酵水槽中，經過約16——36小時的自然發酵，溶除表面果膠後再清洗。
乾燥去殼：繼續曝曬1——3周使含水量降至12%，再以脫殼機除外殼。
水洗豆色澤呈偏藍綠色，豆相美觀，危地馬拉、哥倫比亞、藍山、柯納、肯尼亞、爪哇和巴拿馬咖啡均屬水洗豆。
半水洗法(Semi washed method)
半水洗法，也叫做溼剝法或溼刨法。和其他處理法不同之處在於，過程中並不會直接將咖啡豆曬到含水率11——12%的程度，而是先曬到含水率約30——35%時就脫去表面硬殼，讓生豆表面直接暴露出來，之後在繼續曬乾直到達到不易腐壞且方便儲存的含水率爲止，而這種二次乾燥d的方式使咖啡豆呈現如沼澤般的深綠色外觀。經過半水洗式處理法的咖啡豆，有著較低沉的酸度及更厚實的特性。
半水洗法的咖啡風味介於日曬法與水洗法中間，此處理法盛行於印尼，曼特寧即多采半水洗法，巴西近年也開始使用半水洗法。
半水洗法與水洗法有些相似，先去除咖啡櫻桃漿果的外皮與部分果肉，再曬乾漿果，使漿果乾燥之後再潤溼，接著以特殊機器磨掉果肉、取出種子。
蜜處理 (Honey Process/Miel Process)
蜜處理的意思來自於曝曬前咖啡豆很黏的果膠層，黏的感覺如蜜一般；當咖啡果肉與咖啡豆分離時，外圍包覆著的果膠層經過曝曬，吸收空氣中的溼氣而使果膠層變黏。這裏的“蜜”是指咖啡果肉的黏膜層。採收後的果實一樣會以果皮機剝除外果皮，留著果肉經過日曬，讓果肉的甜度可以進入到豆子，又不用像日曬法花這麼長的時間。
風味呈現：酸度低、甜度較高，同時帶有果香味，口感的乾淨度較日曬豆高，而乾燥後有發酵的葡萄酒尾韻。
去除果皮：將咖啡果實以清水洗淨後，去除果皮、留下果肉
日曬乾燥：保留含有糖分的果肉一起曝曬，此階段必須部段翻攪避免生豆發黴。
取得生豆：完成乾燥後一次去除果肉、果膠和外殼。
蜜處理是目前流行的處理方式，哥斯達黎加和薩爾瓦多等中美洲國家是個中好手。
