目前全世界最重要的咖啡樹主要有阿拉比卡以及羅布斯塔，這兩個品種的咖啡樹是咖啡樹的兩大原種，所產的咖啡豆品質亦優於其他咖啡樹所產的咖啡豆。 

　　啊拉比卡咖啡樹。原產地爲東非埃塞俄比亞的阿拉比卡咖啡樹，其咖啡豆產量佔全世界產量的70%;世界著名的藍山咖啡、摩卡咖啡等，幾乎全是阿拉比卡種。阿拉比卡種的咖啡樹適合種於日夜溫差大的高山，以及溼度低、排水良好的土壤;理想的海拔高度爲500-2000米，海拔越高，品質越好。但由於抗病蟲害的能力較弱，故較其他咖啡樹難種。阿拉比卡豆果實橢圓形，種子呈扁平，還有一些只有一顆種子的，叫着“圓形豆”。阿拉比卡豆口感醇和，香氣突出，從果實中間的裂縫看呈S狀。

　　羅布斯塔咖啡樹。原產地在非洲的剛果(也有人說是在烏干達)，其產量約佔全世界產量的20%~30%。羅布斯塔咖啡樹適合種植於海拔500米以下的低地，對環境的適應性極強，能夠抵抗惡劣氣候，抗拒病蟲侵害，在整地、除草、剪枝時也不需要太多人工照顧，可以任其在野外生長，是一種容易栽培的咖啡樹。但是其風味比阿拉比卡種來的苦澀，品質上也遜色許多，但他卻具有阿拉比卡沒有的質感和粘稠度。一般其咖啡因含量是阿拉比卡豆的兩倍，其果實也較阿拉比卡圓且更小一些。從果實中間的裂縫看呈直線狀。