咖啡的原種有4類：非洲伊索比亞的阿拉比卡種、非洲剛果的羅巴斯塔種與裏培瑞卡種、埃克賽爾沙。以原種加以繁殖研發，至今全世界咖啡品種約有一百多種，其中阿拉比卡種佔百分之七十六，羅巴斯塔種及裏培瑞卡種共佔百分之二十四。

A:阿拉比卡種(Arabica)：目前飲用的咖啡絕大部份是由也門移植到爪哇島栽培成功的阿拉比卡種，它在幾個原種中品質最佳，但因各地的土壤、氣候、天然與人爲因素的不同而風味各異。阿拉比卡種的咖啡因含量約爲羅巴斯塔種的一半。

B:羅巴斯塔種(Robusta)：非洲熱帶區域栽種很多，在十九世紀開始試種時，發現它對病蟲害抵抗力強大，適合種於低窪地區，於是大量栽植，但其品質、風味仍遜於阿拉比卡種。

C:裏培瑞卡種(Libbrica)：樹又高又壯，有18米高，樹葉大而堅韌，果實和咖啡豆也很大，但因味道獨特需求量低，因此產量也小。原產於非洲西海岸，漸漸傳入東方各地，移植爪哇後在短期間內即大受歡迎，然而有一段時間由於遭到蟲害的侵蝕，幾乎被滅種了。現有利比亞、象牙海岸、安哥拉、印尼等國少量栽種。

D:埃克賽爾沙(Excelsa)：快滅絕了，目前世界上已很難見到。