水洗法：光澤好，混入異物少，酸味稍好些，哥倫比亞，墨西哥，危地馬拉採用此法。缺點：時間處理不好會產生臭味和特殊的酸味。

被摘取下來的咖啡櫻桃包括有剛好成熟的，或是過度成熟的，還有尚未成熟的，全都混合在一起。如果不把這些咖啡櫻桃加以分開處理的話，所得到的咖啡豆的品質實在不堪入口，因爲其中夾雜着許多味道很差的雜質。所以這些咖啡櫻桃就要先被洗乾淨，放在滿水的大槽之中準備做初步的分類。最好的咖啡的密度都比較高，所以會沉入水中。而過度成熟的咖啡櫻桃則會浮出水面，很容易就將之分類了。先將咖啡櫻桃外層的果肉除去，然後浸泡在一個很大的盛滿水的水槽內。經過發酵處理之後，水洗式咖啡會有一種特有的鮮明清澈的風味。發酵過後的咖啡豆再以清水洗過，然後排除水份再放在陽光下曬乾或是用機器乾燥。最後用脫殼機將肉果皮和銀皮除去，即可進行篩選並分成不同等級的生咖啡豆。