在19世紀進入肯尼亞，當時埃塞俄比亞的咖啡飲品經由南也門進口到肯尼亞。但直到20世紀初，波旁咖啡樹才由聖．奧斯汀使團(St．AustinMission)引入。

肯尼亞咖啡大多生長在海拔1500--2100米的地方，一年中收穫兩次。爲確保只有成熟的漿果被採摘，人們必須在林間巡迴檢查，來回大約7次。肯尼亞咖啡由小耕農種植，他們收穫咖啡後，先把鮮咖啡豆送到合作清洗站，由清洗站將洗過曬乾的咖啡以“羊皮紙咖啡豆”(即外覆內果皮的咖啡豆)的狀態送到合作社(“羊皮紙咖啡豆”是咖啡豆去皮前的最後狀態)。所有的咖啡都收集在一起，種植者根據其實際的質量按平均價格要價。這種買賣方法總體上運行良好，對種植者及消費者都公平。

肯尼亞北鄰阿拉比卡咖啡樹的原產地衣索匹亞，但遲至二十世紀初交，纔開始從事咖啡栽培業，十九世紀傳教士從葉門引進阿拉比卡樹，但未大量栽種，直到一八九三年，又引進巴西古老的波旁咖啡種籽，才大規模栽培咖啡，也就是說，肯尼亞咖啡帶有巴西血統，由於水士、氣候和處理方式回異，肯尼亞豆風味和巴西豆截然不同。 巴西咖啡的栽種海拔低，質地較軟，果酸味不明顯。反觀肯尼亞咖啡樹主要集中在肯尼亞山附近的坡地，海拔約四千英尺至六千五百英尺，此高度適合咖啡豆發展風味，因爲山區溫度較低，成長較慢，咖啡豆的芳香成分得到充分發展，果酸味更爲明顯，質地也較硬。另外，肯尼亞早期是英國殖民地，英國人已建立一套完善的栽培、品管制度。肯尼亞獨立後，咖啡業在既有基礎上。

肯尼亞的咖啡農莊有兩個類型，一種是佔地五英畝以上的大型栽植場，不過海拔平均較低，就肯尼亞咖啡而言，大農莊的咖啡豆品質只能算中等。極品肯尼亞豆則產自小型農莊，多半位於五、六千英尺以上的山麓或火山坡地，每戶小農每季產能只有二十至七十袋左右，無力投資昂貴的水洗處理廠，但小農很團結，集合數百戶或數千戶成立合作農場，由政府出資興建水洗處理廠，小農採摘的咖啡果子就送往合作農場，統一加工，先剔除半生不熟或爛掉的果子，再進行去皮、發酵、分解果肉，取出咖啡豆，再幹燥和磨光，整個過程由官方的咖啡管理局督導，相當嚴謹，確保了肯尼亞咖啡的品質。肯尼亞豆的水洗加工技術及高標準品管，一直是產豆國表率。

肯尼亞咖啡果

可別小看肯尼亞的小農，他們無異螞蟻雄兵，整體產能高於大型農莊，約呈六比四，這在產豆國相當罕見。肯尼亞咖啡廣受鑑賞家激賞，大半要歸功於小農苦守山麓野地，才能種出優質咖啡。另外，肯尼亞豆定有嚴格的分級制，水洗處理廠取出的咖啡豆，依大小、形狀和硬度，區分爲五個等級，最高級爲PB，其次依序爲AA++、AA+、AA、AB。這種分級制類似哥倫比亞，主要以顆粒大小和外形爲考量，但賣相好不見得風味好。這是咖啡迷應有的認知。 當前國際對肯尼亞豆評價不如往年。相信這與如今氣候反常，不利咖啡成長有關，但事情並不如此單純。這和肯尼亞當局大力推廣抗病力較強，單位產量更高的新品種Ruiru11有關，測味結果，均認爲經濟價值較高的新品種，風味比傳統品種差，更糟的是，Ruiru11就快要取代傳統的阿拉比卡和波旁品種。另外，咖啡品質走衰，拍賣價不佳，小農收入減少，加上咖啡管理局人謀不詭，農人的咖啡熱情大減，當然會影響品質。再者，肯尼亞傑出的水洗技術也退步了，這都是扼殺品質的兇手。

 

另外，肯尼亞早期是英國殖民地，英國人已建立一套完善的栽培,品管制度。肯尼亞獨立後，咖啡業在既有基礎上，大步躍進，成爲肯尼亞創匯的產業。